More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0898 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0898  ribosomal protein L21  100 
 
 
99 aa  197  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000443471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  46.32 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  41.41 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 
188 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.86 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  41.24 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  39.81 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0109  ribosomal protein L21  41.24 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  37.5 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0488  50S ribosomal protein L21  52.63 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  40.82 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  38.78 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_002978  WD0134  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0644  ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.315584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  37.62 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1711  50S ribosomal protein L21  39.18 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  38.24 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.27 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  38.83 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.63 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  40.21 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  45.74 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  45.74 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  36.89 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  39.18 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0545  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>