115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3910 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3910  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.795359  normal  0.0251943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1610  hypothetical protein  64.37 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1920  hypothetical protein  54.31 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2802  hypothetical protein  59.55 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4728  hypothetical protein  50.83 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1783  hypothetical protein  63.41 
 
 		 181 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226713  hitchhiker  0.00393532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2249  hypothetical protein  53.33 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1387  hypothetical protein  44.19 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0805977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2473  hypothetical protein  46.84 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.180948  normal  0.194353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0977  hypothetical protein  59.52 
 
 		 109 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0916  putative ComEA-related signal peptide protein  53.01 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0940  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  46.59 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.705703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2372  putative DNA uptake protein, ComEA-like  42.86 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170687  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0786  putative ComEA-related signal peptide protein  50 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2207  hypothetical protein  45.45 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2387  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1865  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0032  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0867768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2259  putative comE protein  45.45 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1136  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0753  hypothetical protein  47.62 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1815  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  44.58 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2221  putative comE protein  45.45 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1375  hypothetical protein  45.45 
 
 		 321 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2994  helix-hairpin-helix motif  47.62 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.358565  hitchhiker  0.00170682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1428  hypothetical protein  44.32 
 
 		 207 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  decreased coverage  0.00108668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4167  DNA-binding protein  45.24 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5146  hypothetical protein  43.18 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0729  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  41.94 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1755  hypothetical protein  43.18 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2562  hypothetical protein  46.67 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6234  hypothetical protein  43.18 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.815006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1783  hypothetical protein  43.18 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948816  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1845  hypothetical protein  43.18 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1869  hypothetical protein  43.18 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391692  hitchhiker  0.000308285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0575  hypothetical protein  44.05 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1054  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.05 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1013  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.05 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0857  putative ComEA-related signal peptide protein  48.81 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.853655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0507  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.38 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  47.62 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0989  hypothetical protein  45 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  43 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  43 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.48 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0944654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0930  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.65 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0934  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.65 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0420  competence protein ComE  49.18 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2985  competence protein ComE  49.18 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1645  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2564  competence protein ComE  49.18 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0939  competence protein ComE  49.18 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2875  putative competence protein  49.18 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.680946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2938  putative competence protein  49.18 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.496433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0209  competence protein ComE  49.18 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1298  helix-hairpin-helix motif  37.97 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  29.81 
 
 		 265 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  44.29 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  40.24 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.86 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2552  helix-hairpin-helix motif protein  41.27 
 
 		 298 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.11 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  41.82 
 
 		 543 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  44.9 
 
 		 545 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  42.11 
 
 		 243 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0510  hypothetical protein  27.78 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0596  hypothetical protein  27.78 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.368264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.64 
 
 		 222 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  44.9 
 
 		 545 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.4 
 
 		 250 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  35.37 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.5 
 
 		 545 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  36.59 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  36.59 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.1 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0558  Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  40 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.21 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.11 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.98 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  40 
 
 		 279 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1257  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  39.68 
 
 		 422 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0994426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 740 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0995  hypothetical protein  40.3 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1025  helix-hairpin-helix motif protein  38.89 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0837725  normal  0.434373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2230  Soluble ligand binding domain protein  36.36 
 
 		 180 aa  42  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0322679  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.51 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2967  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  41.07 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1611  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.68 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4318  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.6 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.11 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  36.36 
 
 		 111 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0407  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.84 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000244274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0313  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.29 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0283813  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.88 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2573  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.82 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>