94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1387 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1387  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0805977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2473  hypothetical protein  96.49 
 
 		 114 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.180948  normal  0.194353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4728  hypothetical protein  48.54 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1610  hypothetical protein  51.16 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2249  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2802  hypothetical protein  53.16 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1920  hypothetical protein  52.44 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1783  hypothetical protein  57.58 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226713  hitchhiker  0.00393532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0977  hypothetical protein  59.38 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3910  hypothetical protein  42.42 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.795359  normal  0.0251943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0940  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  49.4 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.705703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2372  putative DNA uptake protein, ComEA-like  44 
 
 		 201 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170687  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0575  hypothetical protein  51.58 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1054  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.58 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1815  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  47.62 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1013  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.58 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2207  hypothetical protein  46.91 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1865  hypothetical protein  46.91 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2259  putative comE protein  46.91 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1136  hypothetical protein  46.91 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0753  hypothetical protein  55.22 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2387  hypothetical protein  46.91 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0032  hypothetical protein  46.91 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0867768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2221  putative comE protein  46.91 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4167  DNA-binding protein  51.14 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.25 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0944654  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1375  hypothetical protein  46.91 
 
 		 321 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2994  helix-hairpin-helix motif  55.22 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.358565  hitchhiker  0.00170682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1428  hypothetical protein  46.38 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  decreased coverage  0.00108668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5146  hypothetical protein  46.38 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6234  hypothetical protein  46.38 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.815006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1869  hypothetical protein  46.38 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391692  hitchhiker  0.000308285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1845  hypothetical protein  46.38 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0934  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  53.73 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1755  hypothetical protein  44.93 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1783  hypothetical protein  44.93 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0729  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  44.09 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0930  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  52.24 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0916  putative ComEA-related signal peptide protein  43.53 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0989  hypothetical protein  53.97 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1645  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0939  competence protein ComE  54.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0420  competence protein ComE  54.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2985  competence protein ComE  54.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0209  competence protein ComE  54.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2938  putative competence protein  54.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.496433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2564  competence protein ComE  54.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2875  putative competence protein  54.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.680946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0786  putative ComEA-related signal peptide protein  46.38 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2562  hypothetical protein  44.78 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0507  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.56 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0857  putative ComEA-related signal peptide protein  44.62 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.853655 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1298  helix-hairpin-helix motif  41.27 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  35.51 
 
 		 265 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  39.36 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.61 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2552  helix-hairpin-helix motif protein  51.79 
 
 		 298 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.88 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  43.64 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  36.9 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0558  Fis family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.86 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  36.21 
 
 		 545 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.86 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  36.21 
 
 		 545 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  38.24 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.64 
 
 		 585 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12460  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  48.21 
 
 		 285 aa  43.5  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  40.35 
 
 		 261 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  32.26 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1025  helix-hairpin-helix motif protein  35.48 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0837725  normal  0.434373 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  31.88 
 
 		 1182 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.64 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  39.68 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  39.68 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  48.98 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1611  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.86 
 
 		 278 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0943  comEA protein  37.5 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.98 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.84 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.16 
 
 		 706 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2430  hypothetical protein  46.94 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.93 
 
 		 545 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2967  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  39.29 
 
 		 150 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2211  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.64 
 
 		 320 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2991  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.77 
 
 		 772 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.940851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  33.33 
 
 		 543 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3435  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.1 
 
 		 304 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218719  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.43 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  37.29 
 
 		 279 aa  40.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1518  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.1 
 
 		 377 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.663544  normal  0.893381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  43.75 
 
 		 224 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.93 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>