74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2249 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2249  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2802  hypothetical protein  57.61 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4728  hypothetical protein  55.79 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0977  hypothetical protein  60 
 
 		 109 aa  106  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1920  hypothetical protein  53.12 
 
 		 183 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1387  hypothetical protein  49.07 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0805977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1783  hypothetical protein  56.1 
 
 		 181 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226713  hitchhiker  0.00393532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2473  hypothetical protein  52.33 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.180948  normal  0.194353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1610  hypothetical protein  48.86 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3910  hypothetical protein  53.33 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.795359  normal  0.0251943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0940  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  50 
 
 		 186 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.705703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2372  putative DNA uptake protein, ComEA-like  51.02 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170687  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1815  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  56.1 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0032  hypothetical protein  45.92 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0867768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1865  hypothetical protein  45.92 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2221  putative comE protein  45.92 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2259  putative comE protein  45.92 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1869  hypothetical protein  47.78 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391692  hitchhiker  0.000308285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2387  hypothetical protein  45.92 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1136  hypothetical protein  45.92 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1375  hypothetical protein  45.92 
 
 		 321 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1845  hypothetical protein  47.78 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1428  hypothetical protein  47.78 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  decreased coverage  0.00108668 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6234  hypothetical protein  47.78 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.815006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2207  hypothetical protein  45.92 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5146  hypothetical protein  46.67 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1755  hypothetical protein  46.67 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1783  hypothetical protein  46.67 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948816  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4167  DNA-binding protein  39.81 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0575  hypothetical protein  43.48 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1054  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.48 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1013  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.48 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0916  putative ComEA-related signal peptide protein  45.78 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0786  putative ComEA-related signal peptide protein  47.62 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0753  hypothetical protein  47.06 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2562  hypothetical protein  48.68 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2994  helix-hairpin-helix motif  45.88 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.358565  hitchhiker  0.00170682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.77 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0944654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0989  hypothetical protein  46.84 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0934  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.59 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0930  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.59 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0729  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  46.97 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0857  putative ComEA-related signal peptide protein  44.05 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.853655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0507  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.18 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2552  helix-hairpin-helix motif protein  47.37 
 
 		 298 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1645  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0420  competence protein ComE  44.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0209  competence protein ComE  44.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2938  putative competence protein  44.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.496433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2875  putative competence protein  44.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.680946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0939  competence protein ComE  44.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2564  competence protein ComE  44.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2985  competence protein ComE  44.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  40 
 
 		 545 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  40 
 
 		 545 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  39.34 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  40.54 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  38.3 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1298  helix-hairpin-helix motif  33.33 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  42.25 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  42.25 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  31.43 
 
 		 265 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  41.18 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1025  helix-hairpin-helix motif protein  42.31 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0837725  normal  0.434373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  39.29 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  33.33 
 
 		 543 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.1 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.96 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  41.38 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.21 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.76 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0339  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00775538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  32.88 
 
 		 89 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>