More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5473 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  76.15 
 
 		 241 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  71.97 
 
 		 240 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  71.97 
 
 		 240 aa  360  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  73.53 
 
 		 241 aa  358  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  72.69 
 
 		 241 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  72.69 
 
 		 241 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  72.69 
 
 		 241 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  72.03 
 
 		 241 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  71.55 
 
 		 241 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  73.53 
 
 		 241 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  73.11 
 
 		 241 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  70.71 
 
 		 241 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1786  hypothetical protein  69.87 
 
 		 240 aa  351  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  71.43 
 
 		 241 aa  348  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  69.49 
 
 		 242 aa  340  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  69.75 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  69.33 
 
 		 241 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  68.91 
 
 		 241 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  68.91 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  64.5 
 
 		 233 aa  309  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  64.07 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  64.07 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  61.37 
 
 		 233 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  60.52 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  60.61 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  60.61 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  57.45 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  59.05 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  60.61 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  58.44 
 
 		 356 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  58.01 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  58.44 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  56.28 
 
 		 233 aa  274  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  59.31 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  58.01 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  59.31 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  58.12 
 
 		 233 aa  271  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  58.87 
 
 		 232 aa  271  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  57.2 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  58.87 
 
 		 232 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  58.01 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  58.44 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  56.71 
 
 		 236 aa  268  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  56.28 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  58.87 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  53.07 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  56.65 
 
 		 234 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  54.98 
 
 		 236 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  57.51 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  57.08 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3096  Pirin domain protein  56.9 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  56.71 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  54.94 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  50.44 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  49.57 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  49.57 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  49.79 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2313  pirin domain-containing protein  51.52 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  53.25 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2403  pirin domain-containing protein  50.64 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2407  pirin domain-containing protein  50.64 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.0125724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2448  pirin domain-containing protein  50.86 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  46.78 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  47.64 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1791  Pirin-like  50.21 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  46.38 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  47.64 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  47.64 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  46.78 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  47.64 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  47.21 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  46.78 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  46.78 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  51.52 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1833  Pirin-like protein  50.65 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.441024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  47.19 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  46.78 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  47.64 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3013  pirin domain-containing protein  48.09 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  48.5 
 
 		 231 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1221  pirin domain-containing protein  48.07 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  46.35 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1220  pirin domain-containing protein  48.93 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.110776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1291  pirin domain-containing protein  48.93 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2998  pirin domain-containing protein  47.66 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1676  Pirin-like  48.07 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.192961  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  45.89 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1365  Pirin domain protein  47.23 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3156  pirin domain-containing protein  47.23 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  45.49 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  45.49 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  45.49 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>