More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3123 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  78.45 
 
 		 233 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  79.31 
 
 		 233 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  77.25 
 
 		 233 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  76.82 
 
 		 233 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  75.97 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  71.12 
 
 		 233 aa  352  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  71.67 
 
 		 233 aa  351  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  69.4 
 
 		 233 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  68.53 
 
 		 232 aa  335  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  69.4 
 
 		 232 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  65.8 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  66.38 
 
 		 236 aa  318  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  65.8 
 
 		 232 aa  317  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  65.37 
 
 		 232 aa  316  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  62.77 
 
 		 235 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  62.34 
 
 		 236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  61.9 
 
 		 236 aa  304  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  61.9 
 
 		 233 aa  295  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  60.78 
 
 		 356 aa  294  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  58.87 
 
 		 241 aa  288  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  60.17 
 
 		 232 aa  288  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  58.87 
 
 		 240 aa  287  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  60.61 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  58.44 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  60.61 
 
 		 235 aa  285  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  58.87 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  58.44 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  57.14 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  58.01 
 
 		 232 aa  281  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  58.55 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  58.01 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  58.08 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  58.01 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  58.01 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  58.97 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  58.12 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1786  hypothetical protein  57.14 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  56.9 
 
 		 232 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  58.01 
 
 		 241 aa  277  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  56.9 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  58.44 
 
 		 233 aa  276  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  56.47 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  58.01 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  57.14 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  56.71 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  57.14 
 
 		 241 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  54.31 
 
 		 232 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  55.36 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  57.14 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  50 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3096  Pirin domain protein  54.74 
 
 		 231 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  49.57 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2313  pirin domain-containing protein  51.29 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  49.57 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3029  pirin domain-containing protein  55.36 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  0.309269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1221  pirin domain-containing protein  52.56 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1220  pirin domain-containing protein  53.42 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.110776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1291  pirin domain-containing protein  53.42 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2448  pirin domain-containing protein  50.64 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3013  pirin domain-containing protein  50.63 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2403  pirin domain-containing protein  50.85 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1365  Pirin domain protein  50.63 
 
 		 236 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  50.22 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  49.35 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2407  pirin domain-containing protein  50.85 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.0125724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1791  Pirin-like  50.43 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  49.35 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  49.35 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2998  pirin domain-containing protein  50.21 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3156  pirin domain-containing protein  49.79 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  48.88 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  48.05 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  51.08 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  50.85 
 
 		 231 aa  238  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  48.05 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  48.05 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  48.05 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  48.05 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  48.05 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  48.05 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  48.05 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  48.92 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  48.05 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  51.07 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  49.35 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  50.21 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  45.69 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  47.19 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  47.23 
 
 		 245 aa  231  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  47.62 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  47.62 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  47.62 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1833  Pirin-like protein  51.93 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.441024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0629  Pirin domain protein  46.75 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.415085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  47.19 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>