More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0103 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0103  signal recognition particle protein  100 
 
 
448 aa  900    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl479  signal recognition particle (signal binding protein)  50.7 
 
 
450 aa  433  1e-120  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.87256  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0549  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
447 aa  425  1e-118  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  50 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  47.07 
 
 
446 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  45.67 
 
 
449 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  45.67 
 
 
449 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  45.67 
 
 
449 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  45.67 
 
 
449 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  45.56 
 
 
449 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  45.91 
 
 
449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  45.67 
 
 
449 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  45.91 
 
 
449 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  45.91 
 
 
449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  44.95 
 
 
442 aa  365  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  45.43 
 
 
449 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  45.43 
 
 
449 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  46.15 
 
 
455 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  45.91 
 
 
455 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  45.91 
 
 
455 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  45.41 
 
 
469 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  45.09 
 
 
476 aa  359  5e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.1 
 
 
481 aa  359  6e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  44.34 
 
 
443 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  45.71 
 
 
449 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  46.5 
 
 
452 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  46.5 
 
 
452 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  44.89 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  43.71 
 
 
446 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  43.74 
 
 
445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  45.34 
 
 
453 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  43.45 
 
 
498 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  43.45 
 
 
492 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  44.34 
 
 
435 aa  350  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  46.5 
 
 
448 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  43.2 
 
 
489 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  43.72 
 
 
450 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  44.66 
 
 
444 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  43.61 
 
 
446 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.63 
 
 
446 aa  345  7e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  41.19 
 
 
433 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  44.21 
 
 
518 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  43.12 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  42.58 
 
 
487 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  41.19 
 
 
433 aa  343  4e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  42.58 
 
 
487 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  44.39 
 
 
508 aa  342  8e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.93 
 
 
452 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  44.17 
 
 
444 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  43.06 
 
 
445 aa  341  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  42.49 
 
 
521 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.01 
 
 
490 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.51 
 
 
507 aa  340  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.53 
 
 
491 aa  341  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  43.06 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  41.99 
 
 
485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  44.55 
 
 
449 aa  339  5e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  41.9 
 
 
520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  41.24 
 
 
485 aa  338  8e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  42.68 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.31 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  44.24 
 
 
518 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  43.36 
 
 
492 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  43.36 
 
 
492 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  42.33 
 
 
492 aa  336  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42 
 
 
483 aa  335  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.64 
 
 
496 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  44.72 
 
 
445 aa  333  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  43.6 
 
 
449 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  43 
 
 
512 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  41.75 
 
 
492 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  39.37 
 
 
494 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  43.5 
 
 
448 aa  333  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  43.66 
 
 
453 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  40.61 
 
 
439 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  40.98 
 
 
449 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2279  signal recognition particle protein  44.34 
 
 
435 aa  330  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000146943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.28 
 
 
443 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  42.2 
 
 
443 aa  329  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  43.43 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  41.46 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  41.61 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  42.55 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  42.06 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  42.72 
 
 
489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  43.62 
 
 
441 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.74 
 
 
504 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  42 
 
 
449 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.29 
 
 
492 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  40.81 
 
 
488 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  40.17 
 
 
479 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.77 
 
 
443 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.14 
 
 
449 aa  323  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  40.4 
 
 
458 aa  322  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  40.4 
 
 
458 aa  322  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  42.03 
 
 
444 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  40.62 
 
 
450 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2089  signal recognition particle protein  42.42 
 
 
443 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00342036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  41.71 
 
 
441 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  41.43 
 
 
447 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>