More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl479 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl479  signal recognition particle (signal binding protein)  100 
 
 		 450 aa  900    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.87256  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0549  signal recognition particle protein  73.11 
 
 		 447 aa  665    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0103  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 448 aa  435  1e-120  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.05 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  46.83 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.61 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  44.65 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  44.65 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  45.35 
 
 		 485 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  46.25 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  45.62 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.99 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.56 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  46.46 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  44.8 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  44.72 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  46.02 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.79 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  45.63 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  46.1 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  44.35 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  44.12 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  44.35 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  44.35 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  44.35 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  44.12 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  44.12 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  45.69 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  44.35 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  43.72 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  45.5 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  45.83 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  45.29 
 
 		 492 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  44.57 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  44.12 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  45.2 
 
 		 521 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  44.37 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  44.35 
 
 		 520 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  44.52 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  45.15 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  44.52 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  42.65 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.83 
 
 		 512 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  46.12 
 
 		 448 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  42.67 
 
 		 516 aa  362  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  43.02 
 
 		 488 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  43.95 
 
 		 489 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  45.48 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  47.62 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  45.43 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  45.31 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  41.58 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  45.48 
 
 		 444 aa  359  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  45.31 
 
 		 455 aa  358  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  45.31 
 
 		 455 aa  358  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  46.12 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  46.12 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  45.16 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  43.89 
 
 		 508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  45.79 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  43.83 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.29 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.63 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  41.87 
 
 		 479 aa  355  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  43.49 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  43.49 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  43.93 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.71 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  46.75 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  43.61 
 
 		 442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  46.9 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  42.27 
 
 		 445 aa  353  4e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  42.7 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  43.1 
 
 		 487 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  43.9 
 
 		 458 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  42.6 
 
 		 456 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  43.98 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  43.3 
 
 		 442 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  44.76 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  43.75 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  42.17 
 
 		 448 aa  350  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  43.26 
 
 		 443 aa  349  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  43.4 
 
 		 498 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  44.54 
 
 		 463 aa  349  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  42.82 
 
 		 487 aa  349  7e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.27 
 
 		 515 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  44.27 
 
 		 449 aa  348  8e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  42.16 
 
 		 457 aa  348  8e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.09 
 
 		 491 aa  348  8e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  40.89 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  43.86 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.9 
 
 		 492 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.81 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  44.34 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.18 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  42.92 
 
 		 492 aa  346  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  42.82 
 
 		 485 aa  346  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>