More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0549 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl479  signal recognition particle (signal binding protein)  73.85 
 
 		 450 aa  671    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.87256  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0549  signal recognition particle protein  100 
 
 		 447 aa  893    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0103  signal recognition particle protein  50.67 
 
 		 448 aa  438  9.999999999999999e-123  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  48.64 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.29 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  45.02 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  45.82 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.81 
 
 		 490 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  45.11 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.02 
 
 		 483 aa  362  9e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  44.73 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  45.83 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  43.82 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  44.96 
 
 		 469 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  45.6 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  43.57 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.12 
 
 		 446 aa  359  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  43.81 
 
 		 485 aa  360  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  43.57 
 
 		 492 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  44.55 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  43.15 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  45.04 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  44.08 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  44.08 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  45.39 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  44.08 
 
 		 449 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  44.08 
 
 		 449 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  43.24 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  42.95 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  43.85 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  43.57 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  47.1 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  44.52 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  42.56 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  44.03 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  44.03 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  42.33 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  42.73 
 
 		 445 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  45.35 
 
 		 442 aa  352  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  45.02 
 
 		 452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  42.95 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  43.06 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  42.95 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.31 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  43.33 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  43.86 
 
 		 442 aa  351  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  44.34 
 
 		 498 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  45.32 
 
 		 448 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  44.05 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  43.05 
 
 		 453 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  44.1 
 
 		 489 aa  349  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  44.49 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  42.99 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  42.96 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  44.65 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  43.4 
 
 		 492 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  41.04 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  43.4 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  42.58 
 
 		 439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  40.82 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  41.99 
 
 		 508 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  44.71 
 
 		 452 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  44.71 
 
 		 452 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  44.55 
 
 		 454 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  44.55 
 
 		 454 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  41.48 
 
 		 518 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  43.44 
 
 		 444 aa  342  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  43.36 
 
 		 476 aa  342  7e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.39 
 
 		 507 aa  342  8e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  42.47 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.33 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.03 
 
 		 504 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  42.96 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  43.02 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  44.83 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  41.9 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  41.07 
 
 		 456 aa  339  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.86 
 
 		 491 aa  338  8e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  41.65 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.84 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  41.65 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  42.32 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  43.19 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  42.41 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.15 
 
 		 447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.24 
 
 		 443 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  42.09 
 
 		 447 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  43.02 
 
 		 449 aa  335  7e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  43.71 
 
 		 520 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  42.2 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  42.28 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.35 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  43.2 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>