More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1257 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1257  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1198  polyprenyl synthetase  94.61 
 
 		 299 aa  567  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  33.82 
 
 		 337 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  35.68 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.37 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.82 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  31.23 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.56 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.65 
 
 		 333 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.51 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  34.12 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  29.93 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1597  Polyprenyl synthetase  35.32 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.813492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.89 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33.2 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.17 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.89 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.89 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.27 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  31.56 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  32.3 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  32.3 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  30.89 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  32.3 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  32.3 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  32.3 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.69 
 
 		 343 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  31.43 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.49 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  32.35 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  28.98 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  32.35 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  32.35 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  27.39 
 
 		 336 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  31.93 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  31.43 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  34.48 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.25 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  28.98 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  31.43 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  32.7 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  29.41 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  30.5 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  27.24 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  30.5 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.67 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  30.56 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  32.92 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  30.5 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  31.86 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  29.67 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  31.03 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  31.92 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  27.21 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  29.24 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  28.01 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  36.99 
 
 		 355 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  27.06 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  28.42 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  29.59 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  32.21 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  33.83 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0223  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.92 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.71 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.78 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  30.14 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  33.5 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  29.58 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  29.58 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.33 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  31.71 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  33 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  29.86 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.46 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  32.96 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0088  octaprenyl-diphosphate synthase  32.66 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.52685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1972  trans-hexaprenyltranstransferase  33.51 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1835  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.65 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  26.74 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  32.41 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  29.72 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  29.29 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  28.75 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  31.84 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  29.29 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  27 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>