More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1198 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1198  polyprenyl synthetase  100 
 
 
299 aa  603  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1257  polyprenyl synthetase  94.61 
 
 
298 aa  567  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  32.68 
 
 
323 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  32.68 
 
 
323 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  32.68 
 
 
323 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  32.68 
 
 
323 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  35.27 
 
 
337 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  32.68 
 
 
323 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  32.68 
 
 
323 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  32.68 
 
 
323 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  32.68 
 
 
323 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  32.68 
 
 
323 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.79 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  29.03 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  29.03 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  29.03 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.28 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  29.03 
 
 
331 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  32.19 
 
 
323 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  31.89 
 
 
370 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  31.89 
 
 
370 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  31.89 
 
 
370 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  31.89 
 
 
370 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  31.89 
 
 
370 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  35.07 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.6 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33.75 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  36.22 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  34.27 
 
 
323 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.59 
 
 
323 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.77 
 
 
323 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.09 
 
 
331 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  29.35 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.99 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  28.4 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.27 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  31.43 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.72 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  27.44 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  30.04 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  31.88 
 
 
323 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 
323 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  28.98 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.9 
 
 
325 aa  112  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  33.02 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  29.58 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  29.58 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  29.58 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  31.43 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  30.48 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  30.13 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.33 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  33.99 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  29.08 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  28.98 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  31.11 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  30.93 
 
 
312 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  30.19 
 
 
323 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.19 
 
 
323 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  32.7 
 
 
322 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  29.13 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  31.47 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1597  Polyprenyl synthetase  34.92 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.813492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  29.17 
 
 
333 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.84 
 
 
324 aa  109  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  31.93 
 
 
297 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  32.78 
 
 
325 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  31.93 
 
 
297 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.6 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  33.8 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.88 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  29.26 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  29.29 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  28.97 
 
 
336 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  38.46 
 
 
355 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  31.86 
 
 
342 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  29.29 
 
 
333 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  30.56 
 
 
331 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  28.01 
 
 
323 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  32.34 
 
 
323 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  31.25 
 
 
325 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.95 
 
 
318 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  31.13 
 
 
336 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  33.82 
 
 
325 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  31.51 
 
 
297 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  29.29 
 
 
333 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  31.3 
 
 
337 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  27.11 
 
 
336 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  31.37 
 
 
323 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.06 
 
 
345 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.42 
 
 
317 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  27.73 
 
 
327 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  31.05 
 
 
322 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.54 
 
 
322 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0088  octaprenyl-diphosphate synthase  33.17 
 
 
325 aa  106  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.52685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  28.74 
 
 
336 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0799  octaprenyl-diphosphate synthase  30.8 
 
 
328 aa  105  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.286745  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  26.52 
 
 
334 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.1 
 
 
320 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>