More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1576 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  69.41 
 
 		 256 aa  355  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  68.13 
 
 		 284 aa  344  7e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  62.45 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  59.76 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  47.62 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  47.01 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  47.47 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  47.08 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  47.86 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  48.7 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 271 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0883  ABC transporter related  41.8 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 640 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  43.61 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  44.35 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36.33 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  48.03 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  48.03 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  47.16 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  46.72 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2049  putative Fe3+-siderophores transport system ATPase  44.21 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 279 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  40.97 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  42.73 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  39.76 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  44.44 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  43.64 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.11 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.05 
 
 		 274 aa  154  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  34.76 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  38.84 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  33.86 
 
 		 444 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.33 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.81 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  37.13 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.7 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.49 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  31.65 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.68 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.13 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  35.62 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  43.89 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  40.51 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  42.01 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  41.45 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  38.71 
 
 		 419 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.93 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  41.63 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  41.86 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  32.31 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  36.4 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.65 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  40.76 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  34.55 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  34.4 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.38 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.05 
 
 		 424 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  39.29 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  39.17 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  37.34 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  41.88 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  40.27 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  43.69 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.74 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  32.17 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  31.8 
 
 		 455 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  36.91 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  36.28 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  39.32 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  41.05 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.894018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  34.93 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  34.93 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.93 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  41.1 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>