More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1190 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
289 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  99.63 
 
 
640 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  99.27 
 
 
276 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  99.27 
 
 
276 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  99.27 
 
 
276 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  99.27 
 
 
276 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  99.26 
 
 
274 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  90.91 
 
 
276 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  75.1 
 
 
271 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  71.22 
 
 
279 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  77.17 
 
 
272 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  75.48 
 
 
271 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  76.59 
 
 
270 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  76.19 
 
 
270 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  76.77 
 
 
272 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  76.77 
 
 
272 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  74.19 
 
 
269 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  72.96 
 
 
280 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  51.89 
 
 
278 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  49.59 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  48.41 
 
 
281 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  48.12 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  50 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  48 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
284 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  44.76 
 
 
257 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  48.07 
 
 
257 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  39.68 
 
 
254 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  42.61 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  42 
 
 
264 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  45.41 
 
 
256 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.53 
 
 
268 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.06 
 
 
258 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  36.8 
 
 
285 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40.43 
 
 
274 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 
250 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  40.79 
 
 
267 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  40.62 
 
 
286 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.16 
 
 
255 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
266 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.08 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  41.88 
 
 
271 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  38.13 
 
 
274 aa  146  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.14 
 
 
269 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 
255 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
251 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
253 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
266 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  32.44 
 
 
268 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  41.67 
 
 
384 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  33.05 
 
 
254 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  33.21 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  34.05 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  38.8 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35.24 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  37.76 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  32.95 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  38.28 
 
 
269 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  30.47 
 
 
262 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  35.44 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  33.19 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  33.22 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.05 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  37.79 
 
 
280 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  42.13 
 
 
271 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  38.93 
 
 
268 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  38 
 
 
282 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  36.47 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  38.4 
 
 
282 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  38.4 
 
 
282 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  39.5 
 
 
253 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  41.99 
 
 
274 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  30.89 
 
 
252 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  32.65 
 
 
260 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  38.02 
 
 
283 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  39.82 
 
 
257 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  40.71 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  37.1 
 
 
275 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  38.02 
 
 
283 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  34.78 
 
 
273 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  34.39 
 
 
273 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  34.39 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  45.16 
 
 
257 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.13 
 
 
263 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
271 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.44 
 
 
275 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
274 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>