More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0656 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  100 
 
 
278 aa  547  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  71.8 
 
 
269 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  57.81 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  56.25 
 
 
281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  51.5 
 
 
279 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  50.36 
 
 
640 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
274 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  48.68 
 
 
271 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  51.54 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  51.98 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
279 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  50.81 
 
 
271 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  49.24 
 
 
270 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  48.48 
 
 
270 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  50.61 
 
 
272 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  50.61 
 
 
272 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  50.61 
 
 
272 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  41.27 
 
 
257 aa  188  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
284 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  36.51 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  43.7 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  45.15 
 
 
256 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  40.61 
 
 
269 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  41.15 
 
 
264 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  43.64 
 
 
257 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.35 
 
 
253 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.18 
 
 
290 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
272 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  41.91 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  40.68 
 
 
271 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  41.4 
 
 
285 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2581  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
285 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00566513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.85 
 
 
258 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  41.42 
 
 
265 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  37.65 
 
 
277 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  38.01 
 
 
282 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  45.02 
 
 
267 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.55 
 
 
266 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  39.08 
 
 
261 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  34.25 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
264 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  34.78 
 
 
270 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.28 
 
 
254 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  36.21 
 
 
255 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2444  ferric enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein FepC  35.97 
 
 
272 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2543  ABC transporter related  35.97 
 
 
272 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.02 
 
 
271 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3186  ferric enterobactin ABC transporter ATP-binding protein FepC  35.97 
 
 
272 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0584724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  42.67 
 
 
280 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  43.24 
 
 
267 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  35.37 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  45 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  41.48 
 
 
259 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  42.66 
 
 
286 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 
255 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.44 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  39.45 
 
 
257 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.4 
 
 
267 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  38.33 
 
 
252 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
536 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
273 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 
273 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
273 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
273 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  34.98 
 
 
273 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 
273 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  39.04 
 
 
259 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  32.82 
 
 
455 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  37.41 
 
 
273 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.84 
 
 
255 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  36.84 
 
 
255 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
255 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  36.84 
 
 
269 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  29.96 
 
 
252 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  36.84 
 
 
255 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06304  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
261 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.25 
 
 
419 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
263 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  34.98 
 
 
273 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  30.59 
 
 
418 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>