More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4032 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  50 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  47.08 
 
 
257 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  42.63 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  47.64 
 
 
258 aa  199  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  44.98 
 
 
271 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  47.67 
 
 
256 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  41.73 
 
 
281 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
640 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  41.73 
 
 
279 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  43.43 
 
 
269 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
271 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  45.2 
 
 
270 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  40.87 
 
 
264 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  45.2 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  44.22 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  43.37 
 
 
272 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  43.37 
 
 
272 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  42.57 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 
279 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  41.27 
 
 
278 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.97 
 
 
266 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0883  ABC transporter related  39.46 
 
 
265 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  39.92 
 
 
274 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 
269 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  38.68 
 
 
267 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  37.55 
 
 
257 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  41.7 
 
 
286 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
256 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
274 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  39.59 
 
 
282 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  38.67 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 
273 aa  148  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.74 
 
 
273 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  41.7 
 
 
259 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.67 
 
 
273 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 
273 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 
273 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.67 
 
 
273 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.75 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  38.67 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
273 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.78 
 
 
409 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  37.55 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  41.26 
 
 
285 aa  145  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  38.79 
 
 
303 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  38.52 
 
 
257 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  37.7 
 
 
277 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  32.42 
 
 
259 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  39.29 
 
 
266 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 
273 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  36.17 
 
 
274 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 
273 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 
273 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  34.6 
 
 
274 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  34.6 
 
 
274 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  34.87 
 
 
275 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.03 
 
 
405 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  32.51 
 
 
252 aa  142  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  31.62 
 
 
444 aa  141  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
273 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  37.29 
 
 
424 aa  141  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  37.6 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.29 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  31.37 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  35.1 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  37.22 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  40 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  35.2 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  34.45 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  38.68 
 
 
260 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  40 
 
 
274 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
272 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  32.24 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  39.55 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 
267 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
263 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  36.78 
 
 
260 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.49 
 
 
258 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  35.74 
 
 
293 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  34.04 
 
 
265 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>