More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1921 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  62.8 
 
 		 264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  62.45 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  62.95 
 
 		 284 aa  321  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  62.3 
 
 		 256 aa  311  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  50.79 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  48.21 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  46.85 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  47.64 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0883  ABC transporter related  40.7 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  44.8 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 640 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  43.75 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  43.72 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  43.43 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  45.63 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  44.62 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  44.62 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  45.24 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  45.78 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  43.7 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  40.18 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.07 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  37.82 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.94 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  42.86 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  37.85 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  39.04 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.14 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.5 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.26 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.5 
 
 		 455 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.48 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  33.77 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  33.19 
 
 		 405 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.06 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.67 
 
 		 419 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 		 279 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  37.98 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  36.73 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  42.15 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  43.24 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  41.55 
 
 		 267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  40.71 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.98 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.82 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 536 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  35.02 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2049  putative Fe3+-siderophores transport system ATPase  42.59 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.38 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  33.05 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  38.3 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  32.62 
 
 		 444 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  37.9 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  37.45 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 		 418 aa  141  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  33.33 
 
 		 424 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.29 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  34.26 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  36.61 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  34.4 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  32.29 
 
 		 416 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 490 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  31.33 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  35.94 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  36.02 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.46 
 
 		 418 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  37.93 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  33.33 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  35.9 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  35.84 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  39.91 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  37.04 
 
 		 290 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  38.49 
 
 		 271 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  37.44 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>