More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2787 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  71.8 
 
 		 278 aa  363  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  56.2 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  54.26 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  51.39 
 
 		 279 aa  244  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  50.6 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  50 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  49.59 
 
 		 270 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  48.37 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  49 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  52.76 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 640 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  47.97 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  47.97 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  38.65 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  38.98 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  40.23 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.12 
 
 		 418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.63 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  40.97 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  38.14 
 
 		 258 aa  159  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2543  ABC transporter related  36.29 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2444  ferric enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein FepC  36.29 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3186  ferric enterobactin ABC transporter ATP-binding protein FepC  36.29 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0584724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  38.89 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 536 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.3 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  35.4 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  41.05 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  39.01 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.73 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  42.92 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  41.3 
 
 		 256 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.93 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  38.92 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  35.29 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  41.6 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  39.08 
 
 		 419 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.68 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  43.37 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.35 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  42.29 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.13 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.13 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  39.57 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.96 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  34.8 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  34.8 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.77 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.8 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  39.71 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  40.09 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  41.2 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.91 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  28.07 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  35.37 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.12 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  31.9 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  36.12 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.6 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 273 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  33.61 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  34.21 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  40.62 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  37.72 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  40.27 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  36 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  36.12 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  39.82 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0465  ABC-type transport systems, ATPase components  33.06 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  35.51 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>