More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2398 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 279 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  78.57 
 
 		 281 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  76.62 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  58.14 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  59.14 
 
 		 269 aa  254  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  51.12 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  51.39 
 
 		 279 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  51.42 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  51.82 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  51.82 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  51.2 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 640 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  49.25 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  48.88 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  51.39 
 
 		 280 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  51.01 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  45.45 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  40.48 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  46.96 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  40.56 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  43.67 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  41.73 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  40.64 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.33 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.91 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.1 
 
 		 418 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2759  ABC transporter-related protein  40.7 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.078515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  42.56 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  41.15 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  34.51 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  36.91 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  37.18 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  46.05 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  30 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2581  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00566513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  39.43 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  42.41 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.74 
 
 		 270 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.02 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  41.27 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  39.76 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  33.99 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.78 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  41.15 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  36.99 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  38.82 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  34.96 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  42.17 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.44 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  37.12 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.06 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  36.33 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.92 
 
 		 625 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  34.96 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.2 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  42.62 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  32.02 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.68 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  37 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  39.3 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  34.39 
 
 		 444 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>