More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0276 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  62.8 
 
 
258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  60.8 
 
 
284 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2822  ABC transporter related  59.6 
 
 
256 aa  311  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.606973  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  59.76 
 
 
257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  52.55 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  48.07 
 
 
254 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  42.52 
 
 
269 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0883  ABC transporter related  41.44 
 
 
265 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  40.87 
 
 
257 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
266 aa  175  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  42.32 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  42.19 
 
 
279 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  36.8 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  39.84 
 
 
271 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35.47 
 
 
264 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.79 
 
 
257 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  41.15 
 
 
278 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36.32 
 
 
259 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.04 
 
 
455 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
276 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 
264 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
272 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 
264 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
640 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 
264 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.32 
 
 
409 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
274 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
289 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
266 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  32.34 
 
 
268 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
265 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
264 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  37.67 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.27 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  36.03 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  40.26 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  37.92 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  35.32 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  35.32 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.65 
 
 
253 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.32 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  40.27 
 
 
273 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  37.39 
 
 
273 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 
279 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.99 
 
 
269 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40.28 
 
 
274 aa  149  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.89 
 
 
255 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.33 
 
 
262 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
263 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  40.43 
 
 
272 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  34.63 
 
 
267 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.91 
 
 
418 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  29.91 
 
 
266 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 
271 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  37.92 
 
 
262 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 
256 aa  148  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  29.91 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  33.9 
 
 
444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  41.85 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  40.28 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  35.86 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  33.77 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.13 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  36.24 
 
 
424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.27 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  33.47 
 
 
254 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  34.12 
 
 
253 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
262 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  37.5 
 
 
267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 
269 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  33.05 
 
 
405 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  41.15 
 
 
272 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  34.15 
 
 
265 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  41.15 
 
 
272 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.74 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  36.68 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  41.41 
 
 
270 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  38.1 
 
 
256 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  35.17 
 
 
265 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  35.17 
 
 
265 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.66 
 
 
253 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.17 
 
 
265 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.17 
 
 
265 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.17 
 
 
265 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.17 
 
 
265 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  37.5 
 
 
262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  35.17 
 
 
265 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.17 
 
 
265 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  37.25 
 
 
266 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  36.07 
 
 
257 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 
251 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.74 
 
 
265 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>