43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4271 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  56.19 
 
 
932 aa  946    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  100 
 
 
1015 aa  2086    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  54.13 
 
 
982 aa  1119    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  32.11 
 
 
924 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  27.3 
 
 
959 aa  275  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  27.55 
 
 
948 aa  270  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  28.38 
 
 
1099 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  27.36 
 
 
949 aa  256  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  28.02 
 
 
1098 aa  252  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  28.02 
 
 
1098 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  26.34 
 
 
942 aa  248  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  28.43 
 
 
1098 aa  248  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  30.29 
 
 
1122 aa  248  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  28.13 
 
 
1094 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  25.62 
 
 
1137 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  26.46 
 
 
1109 aa  244  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  29.02 
 
 
953 aa  244  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.85 
 
 
1115 aa  244  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  26.01 
 
 
941 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  26.91 
 
 
950 aa  241  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  28.96 
 
 
936 aa  233  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  27.53 
 
 
1098 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.58 
 
 
1108 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  25.85 
 
 
865 aa  229  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  26.04 
 
 
1109 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  25.44 
 
 
945 aa  224  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  26.82 
 
 
854 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  23.54 
 
 
1090 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  25.89 
 
 
1037 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  26.74 
 
 
1062 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  23.69 
 
 
1034 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.57 
 
 
1050 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  21.44 
 
 
1002 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  21.44 
 
 
1002 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  23.18 
 
 
814 aa  90.1  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.42 
 
 
1122 aa  89.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  22.54 
 
 
1080 aa  75.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.73 
 
 
1068 aa  74.7  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.36 
 
 
1068 aa  74.7  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  24.55 
 
 
834 aa  73.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  35.58 
 
 
934 aa  48.9  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
1361 aa  48.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  36.26 
 
 
1279 aa  48.1  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>