44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0686 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  44.3 
 
 
1109 aa  922    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  100 
 
 
1098 aa  2251    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  43.24 
 
 
1122 aa  858    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  89.89 
 
 
1098 aa  2024    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  89.07 
 
 
1098 aa  2026    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  81.15 
 
 
1098 aa  1833    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  42.06 
 
 
1115 aa  849    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  38.61 
 
 
1137 aa  734    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  35.8 
 
 
1109 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  43.13 
 
 
1094 aa  888    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  43.31 
 
 
1099 aa  858    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.77 
 
 
1108 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  38.32 
 
 
949 aa  611  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  37.92 
 
 
942 aa  589  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  37.58 
 
 
936 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  35.96 
 
 
959 aa  562  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  35.98 
 
 
950 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  35.62 
 
 
945 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  35.46 
 
 
948 aa  544  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  35.37 
 
 
941 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  34.05 
 
 
953 aa  293  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  28.75 
 
 
932 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  27.14 
 
 
982 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  28.02 
 
 
1015 aa  252  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  28.09 
 
 
854 aa  250  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  28.68 
 
 
865 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  27 
 
 
1090 aa  230  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  25.76 
 
 
924 aa  170  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  25.21 
 
 
1034 aa  130  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  24.3 
 
 
1050 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.7 
 
 
1062 aa  115  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  24.17 
 
 
1122 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  24.28 
 
 
1037 aa  113  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  23.17 
 
 
1080 aa  110  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  37.67 
 
 
149 aa  91.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  23.56 
 
 
814 aa  72.4  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  22.78 
 
 
834 aa  68.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2023  hypothetical protein  34.81 
 
 
294 aa  67  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  23.06 
 
 
1002 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  23.06 
 
 
1002 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.7 
 
 
1068 aa  58.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  32.84 
 
 
2125 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  32.84 
 
 
2125 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  20.81 
 
 
1068 aa  48.5  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>