43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2720 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  39.69 
 
 
1109 aa  668    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  53.24 
 
 
936 aa  1002    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  45.56 
 
 
941 aa  832    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  52.13 
 
 
950 aa  996    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  100 
 
 
948 aa  1954    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  54.63 
 
 
942 aa  1061    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  36.65 
 
 
1137 aa  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  47.65 
 
 
945 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  38.63 
 
 
1094 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  49.54 
 
 
959 aa  917    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  58.51 
 
 
949 aa  1169    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  38.56 
 
 
1122 aa  619  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  36.15 
 
 
1099 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  36.63 
 
 
1115 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  35.19 
 
 
1098 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  35.46 
 
 
1098 aa  552  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  34.42 
 
 
1098 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  34.52 
 
 
1098 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.47 
 
 
1108 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  32.92 
 
 
1109 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  30.37 
 
 
953 aa  279  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  27.86 
 
 
1015 aa  273  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  28.62 
 
 
932 aa  273  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.23 
 
 
982 aa  258  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  27.1 
 
 
865 aa  257  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  29.28 
 
 
854 aa  248  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  27.14 
 
 
1090 aa  219  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  25.07 
 
 
924 aa  186  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  24.9 
 
 
1050 aa  111  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.3 
 
 
1062 aa  110  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  24.79 
 
 
1037 aa  105  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  21.79 
 
 
1080 aa  103  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  23.96 
 
 
1122 aa  102  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  24.08 
 
 
1034 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  24.94 
 
 
1002 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  24.94 
 
 
1002 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.66 
 
 
814 aa  87  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  25.06 
 
 
834 aa  81.3  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  32.21 
 
 
149 aa  69.3  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  39.47 
 
 
98 aa  58.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.09 
 
 
1068 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.74 
 
 
1068 aa  48.9  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0983  hypothetical protein  24.15 
 
 
1019 aa  45.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>