39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2758 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  86.42 
 
 
1068 aa  1866    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 
1068 aa  2162    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  26.51 
 
 
814 aa  258  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  28.6 
 
 
834 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  23.34 
 
 
913 aa  92.8  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  23.25 
 
 
911 aa  91.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  23.14 
 
 
914 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  23.29 
 
 
854 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  21.38 
 
 
865 aa  89  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  23.48 
 
 
910 aa  87.8  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  22.87 
 
 
936 aa  81.6  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  21.54 
 
 
1090 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.08 
 
 
1099 aa  76.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  22.56 
 
 
1015 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  22.51 
 
 
959 aa  73.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  21.78 
 
 
924 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  22.75 
 
 
949 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  23.42 
 
 
1109 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  22.42 
 
 
932 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  21.37 
 
 
941 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  23.11 
 
 
950 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  25.22 
 
 
953 aa  62.4  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  22.45 
 
 
942 aa  59.7  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.71 
 
 
1122 aa  59.3  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  23.27 
 
 
1122 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  22.49 
 
 
1098 aa  58.9  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  21.7 
 
 
1098 aa  58.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  21.76 
 
 
1037 aa  57.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  22.89 
 
 
1137 aa  55.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  23.5 
 
 
945 aa  54.7  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  22.09 
 
 
948 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  23.55 
 
 
1094 aa  53.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.69 
 
 
1108 aa  51.2  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  21.27 
 
 
1050 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  20.81 
 
 
1062 aa  47  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  22.75 
 
 
1098 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  21.05 
 
 
1034 aa  45.8  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  38.03 
 
 
1109 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  22.36 
 
 
1098 aa  45.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>