43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0199 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  43.41 
 
 		 1109 aa  907    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  35.89 
 
 		 1109 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  43.04 
 
 		 1099 aa  862    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  37.47 
 
 		 1137 aa  709    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  41.93 
 
 		 1115 aa  842    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  86.25 
 
 		 1098 aa  1956    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  89.89 
 
 		 1098 aa  2050    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  42.89 
 
 		 1122 aa  853    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  100 
 
 		 1098 aa  2253    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  79.87 
 
 		 1098 aa  1805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  43.23 
 
 		 1094 aa  879    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.53 
 
 		 1108 aa  602  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  38.14 
 
 		 942 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  36.81 
 
 		 949 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  36.61 
 
 		 959 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  36.79 
 
 		 936 aa  572  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  36.09 
 
 		 950 aa  549  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  36.34 
 
 		 945 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  34.76 
 
 		 948 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  34.9 
 
 		 941 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  33.02 
 
 		 953 aa  290  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  28.26 
 
 		 932 aa  268  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  28.49 
 
 		 854 aa  255  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.24 
 
 		 982 aa  254  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  28.02 
 
 		 1015 aa  251  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  28.38 
 
 		 865 aa  241  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  25.57 
 
 		 1090 aa  234  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.9 
 
 		 924 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1034 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1062 aa  116  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1050 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1122 aa  112  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1080 aa  110  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1037 aa  108  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  88.6  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.63 
 
 		 814 aa  72  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  22.73 
 
 		 834 aa  64.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  63.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  23.43 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  23.43 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.49 
 
 		 1068 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  31.34 
 
 		 2125 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  31.34 
 
 		 2125 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>