37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5891 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  100 
 
 
1002 aa  2021    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  100 
 
 
1002 aa  2021    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  23.34 
 
 
932 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  21.41 
 
 
1015 aa  94.7  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  25.86 
 
 
941 aa  94.7  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  25.64 
 
 
959 aa  92.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  25.11 
 
 
950 aa  89  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  21.87 
 
 
982 aa  89.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  24.34 
 
 
854 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  24.94 
 
 
948 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.89 
 
 
1115 aa  84.3  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  24.95 
 
 
945 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  25.44 
 
 
865 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  22.25 
 
 
949 aa  82  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.91 
 
 
1108 aa  81.6  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  24.71 
 
 
942 aa  80.5  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.9 
 
 
1099 aa  77.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  25.73 
 
 
1122 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  24.5 
 
 
953 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  24.87 
 
 
1094 aa  72.4  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  23.49 
 
 
936 aa  70.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  24.75 
 
 
1098 aa  70.1  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  22.94 
 
 
1137 aa  68.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  22.39 
 
 
1109 aa  68.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  23.8 
 
 
1098 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  24.72 
 
 
1062 aa  67  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  21.7 
 
 
924 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  25.26 
 
 
1037 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  22.35 
 
 
1109 aa  61.6  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  23.01 
 
 
1050 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  23.72 
 
 
1098 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  22.13 
 
 
1098 aa  58.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  24.07 
 
 
1090 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  25 
 
 
1034 aa  57  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.04 
 
 
1122 aa  53.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  24.5 
 
 
834 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  30.43 
 
 
1080 aa  50.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>