44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1849 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  44.47 
 
 
1109 aa  934    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  37.43 
 
 
1109 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  43.6 
 
 
1099 aa  875    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  37.03 
 
 
1137 aa  718    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  42.82 
 
 
1115 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  79.42 
 
 
1098 aa  1805    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  81.15 
 
 
1098 aa  1854    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  43.11 
 
 
1122 aa  858    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  79.87 
 
 
1098 aa  1825    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  100 
 
 
1098 aa  2256    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  42.91 
 
 
1094 aa  879    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.95 
 
 
1108 aa  596  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  36.7 
 
 
949 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  37.54 
 
 
936 aa  594  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  37.22 
 
 
942 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  36.02 
 
 
959 aa  579  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  36.95 
 
 
945 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  36.42 
 
 
950 aa  569  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  35.11 
 
 
948 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  34.38 
 
 
941 aa  538  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  33.64 
 
 
953 aa  300  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  28.33 
 
 
854 aa  261  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  29.81 
 
 
865 aa  256  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.9 
 
 
982 aa  253  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  26.9 
 
 
932 aa  250  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  27.52 
 
 
1015 aa  241  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  28.21 
 
 
1090 aa  241  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.29 
 
 
924 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  25.88 
 
 
1034 aa  131  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.64 
 
 
1062 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.37 
 
 
1050 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  24.75 
 
 
1037 aa  109  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  24.47 
 
 
1122 aa  108  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  22.81 
 
 
1080 aa  99.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  41.44 
 
 
149 aa  89.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2023  hypothetical protein  31.33 
 
 
294 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  23.57 
 
 
1002 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  23.57 
 
 
1002 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  21.93 
 
 
814 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  22.56 
 
 
834 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  31.62 
 
 
2125 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  31.62 
 
 
2125 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.75 
 
 
1068 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  37.18 
 
 
98 aa  45.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>