44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0237 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  51.45 
 
 		 854 aa  844    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  100 
 
 		 865 aa  1758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  29.52 
 
 		 959 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1099 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  29.72 
 
 		 942 aa  287  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  27.62 
 
 		 949 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1094 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  28.66 
 
 		 932 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1137 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  30.12 
 
 		 950 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  32.17 
 
 		 953 aa  267  7e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  30.33 
 
 		 945 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  29.76 
 
 		 936 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  29.61 
 
 		 1122 aa  261  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  28.06 
 
 		 941 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  30 
 
 		 948 aa  256  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1098 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.46 
 
 		 1115 aa  250  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1109 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1098 aa  243  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  28.68 
 
 		 1098 aa  242  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  28.63 
 
 		 1098 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1109 aa  234  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.68 
 
 		 1108 aa  233  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  25.85 
 
 		 1015 aa  229  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  25.78 
 
 		 982 aa  214  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  25.63 
 
 		 1090 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.43 
 
 		 924 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1050 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1062 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1037 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1034 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.94 
 
 		 814 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1122 aa  100  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1080 aa  95.9  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.52 
 
 		 1068 aa  91.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.51 
 
 		 1068 aa  83.2  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  25.53 
 
 		 1002 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  25.53 
 
 		 1002 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  21.53 
 
 		 834 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  25.11 
 
 		 913 aa  49.3  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0718  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1015 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000573342 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0983  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1019 aa  45.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  23.4 
 
 		 911 aa  44.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>