49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3563 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  67.05 
 
 		 1115 aa  1523    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  42.63 
 
 		 1098 aa  846    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  43.02 
 
 		 1098 aa  840    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  100 
 
 		 1122 aa  2292    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  43.24 
 
 		 1098 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  43.11 
 
 		 1098 aa  850    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  40.77 
 
 		 1137 aa  790    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  40.45 
 
 		 959 aa  666    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  54.45 
 
 		 1094 aa  1217    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  47.18 
 
 		 1099 aa  1013    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  41.19 
 
 		 1109 aa  800    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  53.54 
 
 		 1109 aa  1183    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  40.55 
 
 		 942 aa  666    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  39.84 
 
 		 949 aa  633  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  40.14 
 
 		 936 aa  631  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  38.37 
 
 		 950 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  38.36 
 
 		 948 aa  612  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  38.82 
 
 		 945 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.13 
 
 		 1108 aa  582  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  36.41 
 
 		 941 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  29.01 
 
 		 854 aa  304  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  32.88 
 
 		 953 aa  275  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  29.61 
 
 		 865 aa  261  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  30.29 
 
 		 1015 aa  248  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  28.98 
 
 		 982 aa  238  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  26.17 
 
 		 932 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  26.33 
 
 		 1090 aa  224  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  28.2 
 
 		 924 aa  193  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1050 aa  125  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1062 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1034 aa  121  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2023  hypothetical protein  43.05 
 
 		 294 aa  107  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  39.04 
 
 		 149 aa  106  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1122 aa  104  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  56.04 
 
 		 98 aa  92  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1037 aa  87.4  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1080 aa  83.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  25.73 
 
 		 1002 aa  79  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  25.73 
 
 		 1002 aa  79  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  23.71 
 
 		 834 aa  72.4  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  23.69 
 
 		 814 aa  70.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  33.58 
 
 		 2125 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  33.58 
 
 		 2125 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.27 
 
 		 1068 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.61 
 
 		 1068 aa  55.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  23.12 
 
 		 911 aa  55.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  23.36 
 
 		 913 aa  53.5  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  23.54 
 
 		 914 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2989  hypothetical protein  52.5 
 
 		 57 aa  46.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>