38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2007 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  62.39 
 
 		 932 aa  1036    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  100 
 
 		 982 aa  2020    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  54.13 
 
 		 1015 aa  1119    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  34.3 
 
 		 924 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  28.15 
 
 		 949 aa  278  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1137 aa  277  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1098 aa  263  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1109 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  27.2 
 
 		 959 aa  258  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  27.14 
 
 		 1098 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1094 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  29.12 
 
 		 1098 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  26.23 
 
 		 948 aa  252  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  29.86 
 
 		 942 aa  249  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.82 
 
 		 1115 aa  248  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1099 aa  245  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  30.28 
 
 		 936 aa  242  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  26.69 
 
 		 941 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1098 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  28.98 
 
 		 1122 aa  238  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  26.91 
 
 		 950 aa  238  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  26.66 
 
 		 945 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  28.78 
 
 		 953 aa  220  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  25.78 
 
 		 865 aa  214  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1109 aa  211  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.24 
 
 		 1108 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  25.5 
 
 		 854 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  24.75 
 
 		 1090 aa  181  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1037 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1050 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1034 aa  98.2  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1062 aa  95.9  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  22.33 
 
 		 1002 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  22.33 
 
 		 1002 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1122 aa  77  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1080 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.8 
 
 		 814 aa  71.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  21.56 
 
 		 834 aa  55.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>