43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3011 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  41.21 
 
 		 1109 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  78.47 
 
 		 936 aa  1471    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  49.69 
 
 		 941 aa  921    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  63.24 
 
 		 950 aa  1226    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  54.63 
 
 		 948 aa  1053    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  100 
 
 		 942 aa  1927    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  40.55 
 
 		 1122 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  39.58 
 
 		 1137 aa  707    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  53.57 
 
 		 945 aa  988    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  41.55 
 
 		 1094 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  53.22 
 
 		 959 aa  1036    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  39.94 
 
 		 1099 aa  652    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  55.38 
 
 		 949 aa  1068    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  38.78 
 
 		 1115 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1098 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  37.92 
 
 		 1098 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  37.93 
 
 		 1098 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1098 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1109 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.32 
 
 		 1108 aa  502  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  29.72 
 
 		 865 aa  287  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  32.09 
 
 		 953 aa  283  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  31.82 
 
 		 932 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  27.28 
 
 		 854 aa  250  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  29.86 
 
 		 982 aa  249  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  26.34 
 
 		 1015 aa  248  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  28.37 
 
 		 1090 aa  235  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.17 
 
 		 924 aa  208  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1050 aa  124  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1034 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1062 aa  121  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1037 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1080 aa  102  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1122 aa  98.6  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  24.71 
 
 		 1002 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  24.71 
 
 		 1002 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  20.81 
 
 		 814 aa  79  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  34.64 
 
 		 149 aa  76.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  23.08 
 
 		 834 aa  61.6  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.45 
 
 		 1068 aa  59.7  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.08 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  33.68 
 
 		 98 aa  51.6  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0983  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1019 aa  46.2  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>