43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3345 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  100 
 
 		 834 aa  1692    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  36.69 
 
 		 814 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.45 
 
 		 1068 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.07 
 
 		 1068 aa  209  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  25.14 
 
 		 914 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  24.18 
 
 		 910 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  24.45 
 
 		 913 aa  104  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  23.9 
 
 		 911 aa  103  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  21.22 
 
 		 950 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  22.44 
 
 		 953 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  25.72 
 
 		 932 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  24.94 
 
 		 948 aa  82  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  21.75 
 
 		 1090 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  21.85 
 
 		 959 aa  77  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.27 
 
 		 1115 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  21.53 
 
 		 865 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  22.31 
 
 		 854 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  24.55 
 
 		 1015 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  23.46 
 
 		 1122 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  21.94 
 
 		 941 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1034 aa  69.7  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  24.04 
 
 		 936 aa  69.3  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1109 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  23.06 
 
 		 1098 aa  68.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  23.44 
 
 		 945 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1094 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1098 aa  65.1  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  21.55 
 
 		 924 aa  64.3  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  20.45 
 
 		 1137 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1109 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  23 
 
 		 1098 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  21.76 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  23.08 
 
 		 942 aa  61.6  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.72 
 
 		 1108 aa  61.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1099 aa  61.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1098 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1050 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  21.62 
 
 		 982 aa  57  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1037 aa  56.2  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  24.5 
 
 		 1002 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  24.5 
 
 		 1002 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1122 aa  47.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>