47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2495 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 
1115 aa  2281    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  52.63 
 
 
1109 aa  1175    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  41.34 
 
 
1098 aa  822    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  41.36 
 
 
1109 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  42.06 
 
 
1098 aa  849    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  54.2 
 
 
1094 aa  1181    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  67.05 
 
 
1122 aa  1523    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  41.92 
 
 
1098 aa  840    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  47.32 
 
 
1099 aa  1031    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  42.71 
 
 
1098 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  38.32 
 
 
1137 aa  752    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  38.78 
 
 
942 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  38.76 
 
 
959 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  38.71 
 
 
950 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  37.92 
 
 
949 aa  624  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  40.04 
 
 
936 aa  621  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  37.33 
 
 
945 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.57 
 
 
1108 aa  586  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  36.63 
 
 
948 aa  578  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  35.69 
 
 
941 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  31.47 
 
 
953 aa  282  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  28.72 
 
 
854 aa  274  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  28.46 
 
 
865 aa  250  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  28.82 
 
 
982 aa  248  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  29.85 
 
 
1015 aa  244  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  28.36 
 
 
932 aa  235  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  27.04 
 
 
1090 aa  231  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  28.35 
 
 
924 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  26.61 
 
 
1050 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.74 
 
 
1062 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  24.05 
 
 
1034 aa  124  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  23.39 
 
 
1122 aa  106  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  22.75 
 
 
1080 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  25.33 
 
 
1037 aa  97.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2023  hypothetical protein  34.66 
 
 
294 aa  90.9  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  57.33 
 
 
98 aa  86.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  24.89 
 
 
1002 aa  85.5  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  24.89 
 
 
1002 aa  85.5  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  33.11 
 
 
149 aa  85.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  23.47 
 
 
834 aa  77  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  33.33 
 
 
2125 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  33.33 
 
 
2125 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  23.47 
 
 
913 aa  61.6  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.33 
 
 
814 aa  60.1  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  22.93 
 
 
911 aa  58.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  22.4 
 
 
910 aa  52  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.46 
 
 
1068 aa  45.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>