39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1602 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  100 
 
 
1080 aa  2224    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  28.29 
 
 
1050 aa  361  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  29.39 
 
 
1034 aa  360  9e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  28.74 
 
 
1037 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  28.11 
 
 
1062 aa  340  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  24.59 
 
 
949 aa  144  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  24.42 
 
 
959 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  30.16 
 
 
953 aa  129  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  23.97 
 
 
1098 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  25.15 
 
 
1099 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  24.26 
 
 
1098 aa  124  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  23.74 
 
 
1098 aa  118  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  22.48 
 
 
948 aa  117  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  23.42 
 
 
936 aa  116  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  22.89 
 
 
942 aa  116  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.45 
 
 
1115 aa  111  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  23.62 
 
 
950 aa  111  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  22.59 
 
 
865 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  23.8 
 
 
941 aa  110  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  23.02 
 
 
1090 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  23.68 
 
 
1094 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  22.85 
 
 
1137 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  24.13 
 
 
945 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  23.91 
 
 
1098 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  23.51 
 
 
1109 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  22.16 
 
 
1109 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  23.5 
 
 
932 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  23.29 
 
 
1122 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  20.34 
 
 
1108 aa  92.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0548  hypothetical protein  30.81 
 
 
385 aa  91.7  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  24.06 
 
 
1015 aa  91.3  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  23.11 
 
 
924 aa  89  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  26.44 
 
 
854 aa  89  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  24.37 
 
 
1122 aa  87  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  24.12 
 
 
982 aa  86.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  23.31 
 
 
834 aa  79.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  20.91 
 
 
814 aa  52.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  30.43 
 
 
1002 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  30.43 
 
 
1002 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>