42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0639 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  38.61 
 
 
1115 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  37.25 
 
 
1098 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  38.45 
 
 
936 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  37.55 
 
 
1098 aa  707    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  39.21 
 
 
950 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  37.08 
 
 
948 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  40.8 
 
 
1122 aa  796    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  38.87 
 
 
1098 aa  739    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  38.64 
 
 
1098 aa  721    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  100 
 
 
1137 aa  2352    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  37.13 
 
 
959 aa  664    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  39.45 
 
 
1094 aa  783    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  41.07 
 
 
1099 aa  805    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  39.9 
 
 
942 aa  715    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  40.43 
 
 
949 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  40.8 
 
 
1109 aa  824    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  37.13 
 
 
945 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  37.36 
 
 
941 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  33.53 
 
 
1109 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.92 
 
 
1108 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  32.18 
 
 
953 aa  295  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  27.46 
 
 
982 aa  277  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  29.64 
 
 
865 aa  271  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  27.23 
 
 
854 aa  259  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  27.79 
 
 
932 aa  257  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  25.62 
 
 
1015 aa  246  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  26.43 
 
 
1090 aa  223  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.1 
 
 
924 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  52.03 
 
 
149 aa  156  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  24.84 
 
 
1034 aa  146  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  26.31 
 
 
1050 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.79 
 
 
1062 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  25.27 
 
 
1037 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.55 
 
 
1122 aa  95.5  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  22.85 
 
 
1080 aa  88.6  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.49 
 
 
814 aa  78.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  22.94 
 
 
1002 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  22.94 
 
 
1002 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  39.77 
 
 
98 aa  65.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  20.45 
 
 
834 aa  64.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.39 
 
 
1068 aa  58.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.89 
 
 
1068 aa  55.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>