42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0198 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  48.59 
 
 		 949 aa  899    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  47.34 
 
 		 959 aa  872    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  100 
 
 		 945 aa  1926    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  53.57 
 
 		 942 aa  1003    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  51.77 
 
 		 936 aa  929    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  66.07 
 
 		 941 aa  1295    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  51.62 
 
 		 950 aa  964    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  47.65 
 
 		 948 aa  862    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  39.3 
 
 		 1109 aa  632  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  38.83 
 
 		 1094 aa  623  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1137 aa  622  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  38.82 
 
 		 1122 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  37.33 
 
 		 1115 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  35.93 
 
 		 1099 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1098 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1098 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  35.62 
 
 		 1098 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  35.92 
 
 		 1098 aa  548  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1109 aa  465  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.76 
 
 		 1108 aa  459  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  32.32 
 
 		 953 aa  274  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  30.58 
 
 		 865 aa  266  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  30.26 
 
 		 854 aa  254  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  25.44 
 
 		 1015 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.66 
 
 		 982 aa  231  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  29.43 
 
 		 932 aa  224  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  28.67 
 
 		 1090 aa  211  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.1 
 
 		 924 aa  178  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1050 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1034 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1062 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1037 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1122 aa  105  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1080 aa  97.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  23.05 
 
 		 814 aa  95.9  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  25.15 
 
 		 1002 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  25.15 
 
 		 1002 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  38.79 
 
 		 149 aa  72  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  23.96 
 
 		 834 aa  68.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.46 
 
 		 1068 aa  68.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.27 
 
 		 1068 aa  67.8  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  23.66 
 
 		 914 aa  47.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>