43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1355 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1034 aa  733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  83.03 
 
 		 1050 aa  1785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 1062 aa  2169    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  36.39 
 
 		 1037 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1080 aa  333  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0548  hypothetical protein  34.43 
 
 		 385 aa  183  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  26.68 
 
 		 1090 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  26.71 
 
 		 936 aa  140  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  25.35 
 
 		 950 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1137 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  26.96 
 
 		 865 aa  135  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.74 
 
 		 1115 aa  135  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  25.36 
 
 		 941 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1094 aa  131  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  25.04 
 
 		 1122 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  26.54 
 
 		 942 aa  127  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  26.09 
 
 		 949 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  24.05 
 
 		 1098 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  25.7 
 
 		 1098 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  25.84 
 
 		 945 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  22.53 
 
 		 959 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1098 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  25.3 
 
 		 948 aa  114  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1098 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  26.87 
 
 		 953 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  26.19 
 
 		 854 aa  110  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1109 aa  104  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  26.46 
 
 		 1015 aa  104  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1099 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  25.09 
 
 		 982 aa  97.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1109 aa  96.3  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.95 
 
 		 1108 aa  94.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  26.71 
 
 		 932 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  23.97 
 
 		 924 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.84 
 
 		 814 aa  77.4  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0549  hypothetical protein  53.03 
 
 		 66 aa  74.7  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1122 aa  70.1  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  24.72 
 
 		 1002 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  24.72 
 
 		 1002 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  21.41 
 
 		 834 aa  55.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.32 
 
 		 1068 aa  53.9  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.35 
 
 		 1068 aa  46.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0718  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1015 aa  45.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000573342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>