34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0386 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  86.42 
 
 
1068 aa  1840    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 
1068 aa  2161    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  28.22 
 
 
814 aa  251  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  29.07 
 
 
834 aa  208  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  22.52 
 
 
865 aa  91.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  22.86 
 
 
913 aa  87.8  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  22.18 
 
 
911 aa  85.9  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  22.91 
 
 
854 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  22.24 
 
 
914 aa  85.5  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  21.63 
 
 
910 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  22.52 
 
 
936 aa  78.2  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  22.36 
 
 
1015 aa  74.7  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  22.39 
 
 
924 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  23.67 
 
 
1109 aa  68.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  21.86 
 
 
941 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  21.57 
 
 
1090 aa  68.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  23.44 
 
 
959 aa  68.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  22.99 
 
 
945 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  23.68 
 
 
1099 aa  65.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  22.79 
 
 
949 aa  65.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  22.56 
 
 
1137 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  21.16 
 
 
950 aa  57  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  22.08 
 
 
942 aa  56.2  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  26.09 
 
 
1122 aa  56.2  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  24.61 
 
 
1122 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  25.52 
 
 
1094 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  22.24 
 
 
1037 aa  51.6  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  21.78 
 
 
1098 aa  50.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.02 
 
 
1108 aa  48.9  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  21.74 
 
 
948 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  20.81 
 
 
1098 aa  48.9  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  37.97 
 
 
1109 aa  46.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.46 
 
 
1115 aa  45.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  42.86 
 
 
953 aa  45.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>