42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0274 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  100 
 
 		 1037 aa  2139    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1050 aa  569  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  36.39 
 
 		 1062 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1034 aa  469  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1080 aa  340  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  23.77 
 
 		 1090 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  23.23 
 
 		 865 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  25.53 
 
 		 936 aa  123  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  25.05 
 
 		 950 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  24.63 
 
 		 942 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.9 
 
 		 1108 aa  120  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  24.9 
 
 		 1098 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  25.93 
 
 		 941 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  25.97 
 
 		 1015 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  25.46 
 
 		 949 aa  115  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1137 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1098 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  25.22 
 
 		 854 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  25.96 
 
 		 1098 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  25.62 
 
 		 948 aa  111  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1098 aa  111  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1099 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  25.16 
 
 		 959 aa  110  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.52 
 
 		 1115 aa  106  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  23 
 
 		 1094 aa  105  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  23.32 
 
 		 953 aa  105  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  23.22 
 
 		 945 aa  104  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.27 
 
 		 982 aa  101  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  27.24 
 
 		 932 aa  98.2  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1109 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0548  hypothetical protein  27.11 
 
 		 385 aa  93.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1109 aa  92  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  24.02 
 
 		 1122 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  24.2 
 
 		 924 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  25.26 
 
 		 1002 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  25.26 
 
 		 1002 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1122 aa  65.1  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  21.71 
 
 		 814 aa  63.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.76 
 
 		 1068 aa  57.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  21.31 
 
 		 834 aa  56.2  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0549  hypothetical protein  38.46 
 
 		 66 aa  51.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.24 
 
 		 1068 aa  51.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>