44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0636 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  49.69 
 
 
942 aa  921    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  48.59 
 
 
936 aa  863    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  100 
 
 
941 aa  1939    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  48.96 
 
 
950 aa  916    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  45.56 
 
 
948 aa  820    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  66.07 
 
 
945 aa  1281    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  46.4 
 
 
959 aa  848    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  46.4 
 
 
949 aa  836    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  36.95 
 
 
1137 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  37.22 
 
 
1094 aa  593  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  37.59 
 
 
1109 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  36.2 
 
 
1099 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.69 
 
 
1115 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  36.41 
 
 
1122 aa  561  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  35.37 
 
 
1098 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  35.42 
 
 
1098 aa  542  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  34.52 
 
 
1098 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  34.35 
 
 
1098 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  32.57 
 
 
1109 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.37 
 
 
1108 aa  445  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  31.56 
 
 
953 aa  263  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  28.06 
 
 
865 aa  256  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  26.01 
 
 
1015 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.69 
 
 
982 aa  242  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  30.43 
 
 
854 aa  239  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  27.9 
 
 
932 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  29.06 
 
 
1090 aa  220  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.2 
 
 
924 aa  164  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.12 
 
 
1050 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  24.72 
 
 
1062 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  26.35 
 
 
1034 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  25.31 
 
 
1037 aa  110  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  25.86 
 
 
1002 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  25.86 
 
 
1002 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  26.43 
 
 
1122 aa  95.5  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  23.8 
 
 
1080 aa  93.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  23.08 
 
 
814 aa  91.7  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  21.94 
 
 
834 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.07 
 
 
1068 aa  68.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.86 
 
 
1068 aa  68.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  37.93 
 
 
149 aa  57.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  25.44 
 
 
914 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  25.51 
 
 
913 aa  49.3  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  44.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>