41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0015 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  39.85 
 
 		 1034 aa  728    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  100 
 
 		 1050 aa  2155    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  83.03 
 
 		 1062 aa  1763    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1037 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1080 aa  340  8e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0548  hypothetical protein  33.83 
 
 		 385 aa  180  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  24.7 
 
 		 1090 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.61 
 
 		 1115 aa  144  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  24.28 
 
 		 950 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  23.98 
 
 		 936 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  25.96 
 
 		 865 aa  135  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1137 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  25.12 
 
 		 941 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1094 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  25.11 
 
 		 1122 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  26.11 
 
 		 945 aa  124  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  26.02 
 
 		 942 aa  124  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  25.61 
 
 		 949 aa  124  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  22.65 
 
 		 959 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  24.3 
 
 		 1098 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  23.99 
 
 		 1098 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  25.08 
 
 		 854 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  24.9 
 
 		 948 aa  111  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1098 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1098 aa  109  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1109 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  26.43 
 
 		 953 aa  105  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1109 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1099 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.74 
 
 		 1108 aa  99.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  25.91 
 
 		 982 aa  99.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  25.7 
 
 		 1015 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  27.56 
 
 		 932 aa  91.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  24.03 
 
 		 814 aa  83.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  24.33 
 
 		 924 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0549  hypothetical protein  54.55 
 
 		 66 aa  75.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1122 aa  68.9  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  22.96 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  22.96 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  20.96 
 
 		 834 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  20.72 
 
 		 1068 aa  47.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>