40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3115 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  100 
 
 
1090 aa  2244    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  27.67 
 
 
1094 aa  240  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  29.32 
 
 
936 aa  239  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  28.21 
 
 
1098 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  28.37 
 
 
942 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  26.11 
 
 
1099 aa  232  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  25.94 
 
 
959 aa  232  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  27.21 
 
 
1098 aa  232  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  26.51 
 
 
932 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.04 
 
 
1115 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  26.78 
 
 
1098 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  27.1 
 
 
1109 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  27 
 
 
1098 aa  230  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  28.05 
 
 
953 aa  226  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  26.43 
 
 
1137 aa  224  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  26.33 
 
 
1122 aa  224  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  26.89 
 
 
1109 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  29.06 
 
 
941 aa  220  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  26.86 
 
 
949 aa  219  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  27.14 
 
 
948 aa  219  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  27.79 
 
 
950 aa  214  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  28.43 
 
 
945 aa  204  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.02 
 
 
1108 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  26.18 
 
 
854 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  24.75 
 
 
982 aa  181  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  25.63 
 
 
865 aa  179  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  23.54 
 
 
1015 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  24.85 
 
 
1050 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  23.38 
 
 
1037 aa  140  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  26.52 
 
 
1062 aa  131  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.58 
 
 
924 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  25.12 
 
 
1034 aa  130  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  23.02 
 
 
1080 aa  94  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  21.98 
 
 
834 aa  78.2  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.81 
 
 
1068 aa  75.1  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  23.31 
 
 
1122 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  21.52 
 
 
814 aa  69.3  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.57 
 
 
1068 aa  68.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  23.56 
 
 
1002 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  23.56 
 
 
1002 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>