42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1807 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  100 
 
 
1122 aa  2275    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  24.77 
 
 
1094 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  24.05 
 
 
1098 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  26.48 
 
 
953 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  24.43 
 
 
1098 aa  121  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  25.71 
 
 
1109 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  24.89 
 
 
1098 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  28.31 
 
 
1099 aa  115  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  24.73 
 
 
1098 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  22.57 
 
 
854 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.39 
 
 
1115 aa  108  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  25.12 
 
 
942 aa  108  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  24.53 
 
 
948 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  27.07 
 
 
950 aa  107  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  26.76 
 
 
1122 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  27.49 
 
 
945 aa  104  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  25.44 
 
 
936 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.81 
 
 
1108 aa  103  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  22.32 
 
 
1137 aa  101  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  21.61 
 
 
865 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  25.65 
 
 
949 aa  100  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  26.92 
 
 
959 aa  100  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  26.43 
 
 
941 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  21.63 
 
 
1109 aa  99  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  22.7 
 
 
1015 aa  97.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  22.24 
 
 
932 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.84 
 
 
982 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  24.77 
 
 
1080 aa  78.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  23.58 
 
 
1090 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  25.26 
 
 
924 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  23.51 
 
 
1062 aa  75.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  23.2 
 
 
1050 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  23.51 
 
 
1037 aa  71.6  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  21.26 
 
 
814 aa  64.3  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.24 
 
 
1068 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  21.73 
 
 
1034 aa  61.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.54 
 
 
1068 aa  58.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  22.48 
 
 
1002 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  22.48 
 
 
1002 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  22.59 
 
 
834 aa  52  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  21.07 
 
 
910 aa  48.5  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0718  hypothetical protein  30.11 
 
 
1015 aa  44.7  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000573342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>