42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1017 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 
1108 aa  2247    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  35.77 
 
 
1098 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  35.06 
 
 
1094 aa  610  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  36.15 
 
 
1109 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  35.94 
 
 
1099 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  35.61 
 
 
1098 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  35.67 
 
 
1098 aa  592  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.57 
 
 
1115 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  35.13 
 
 
1122 aa  582  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  34.66 
 
 
1098 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  31.75 
 
 
1137 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  35.32 
 
 
942 aa  502  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  34.28 
 
 
959 aa  485  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  34.22 
 
 
950 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  34.36 
 
 
948 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  35.19 
 
 
936 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  31.55 
 
 
1109 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  34.09 
 
 
949 aa  459  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  34.76 
 
 
945 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  33.37 
 
 
941 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  31.11 
 
 
953 aa  274  7e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  27.84 
 
 
932 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  27.68 
 
 
865 aa  233  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  27.58 
 
 
1015 aa  229  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  28.29 
 
 
854 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  25.24 
 
 
982 aa  209  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  26.02 
 
 
1090 aa  200  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  31.57 
 
 
924 aa  173  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  24.57 
 
 
1037 aa  118  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  24.97 
 
 
1034 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  25.74 
 
 
1050 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  22.81 
 
 
1122 aa  98.2  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  24.95 
 
 
1062 aa  89  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  23.91 
 
 
1002 aa  82.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  23.91 
 
 
1002 aa  82.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  19.63 
 
 
1080 aa  76.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  24.72 
 
 
834 aa  62.4  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  30.4 
 
 
149 aa  60.1  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  20.62 
 
 
814 aa  53.5  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.69 
 
 
1068 aa  52  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.02 
 
 
1068 aa  48.9  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  35.42 
 
 
98 aa  48.9  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>