14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2127 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  85.61 
 
 		 913 aa  1408    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  75.99 
 
 		 910 aa  1434    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  75.54 
 
 		 914 aa  1451    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  100 
 
 		 911 aa  1867    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  23.9 
 
 		 834 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.25 
 
 		 1068 aa  91.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.55 
 
 		 814 aa  87.8  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.18 
 
 		 1068 aa  85.9  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.93 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  23.12 
 
 		 1122 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1099 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  25.61 
 
 		 854 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  23.42 
 
 		 959 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  23.4 
 
 		 865 aa  44.3  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>