32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3756 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3756  integrins alpha chain  100 
 
 		 119 aa  237  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  48.33 
 
 		 917 aa  112  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.46 
 
 		 547 aa  98.6  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  41.13 
 
 		 709 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  44.07 
 
 		 1019 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 1022 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 1017 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  46.61 
 
 		 1175 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  44.54 
 
 		 1055 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45 
 
 		 3427 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  42.74 
 
 		 652 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48.36 
 
 		 813 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  40.83 
 
 		 1037 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  43.59 
 
 		 1346 aa  90.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  36.67 
 
 		 395 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  35.83 
 
 		 395 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.82 
 
 		 1372 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.32 
 
 		 1180 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 588 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 		 565 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 540 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 540 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  35.54 
 
 		 546 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  32.32 
 
 		 2567 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  31.09 
 
 		 531 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  31.09 
 
 		 531 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  31.93 
 
 		 1143 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  31.93 
 
 		 1072 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 574 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1081  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4916  hemolysin-type calcium-binding region  34.04 
 
 		 452 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>