13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1081 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1081  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  61.54 
 
 		 3427 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  57.69 
 
 		 1175 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.91 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  47.17 
 
 		 652 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  48.98 
 
 		 1017 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  48.98 
 
 		 1022 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  50 
 
 		 1055 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  48.08 
 
 		 917 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  42 
 
 		 1037 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  37.74 
 
 		 709 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  38.46 
 
 		 1346 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.58 
 
 		 1019 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>