60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0430 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  671    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  45 
 
 
358 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  37.71 
 
 
362 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  33.24 
 
 
367 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  38.08 
 
 
356 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  32.41 
 
 
369 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  36.65 
 
 
355 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  33.44 
 
 
366 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  36.25 
 
 
367 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  35.55 
 
 
362 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  27.95 
 
 
371 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  33.76 
 
 
365 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  35.94 
 
 
375 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  32.3 
 
 
361 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  28.49 
 
 
366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  34.49 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  29.62 
 
 
367 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  30.2 
 
 
360 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  31.33 
 
 
366 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  32.24 
 
 
372 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  31.55 
 
 
381 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  33.66 
 
 
368 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  33.13 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  28.81 
 
 
360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  29.71 
 
 
360 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  27.82 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  30.57 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  31.14 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  29.53 
 
 
369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  30.56 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  35.16 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  31.46 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  34.08 
 
 
390 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  32.76 
 
 
374 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  30.38 
 
 
325 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  26.92 
 
 
369 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  32.41 
 
 
362 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  28.14 
 
 
983 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  29.96 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  25.75 
 
 
369 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  27.09 
 
 
372 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  25.63 
 
 
371 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  27.58 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  28.5 
 
 
999 aa  95.9  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  34.32 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  26.43 
 
 
354 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  28.91 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
994 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  25.88 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  25.88 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  27.87 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  27.74 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  28.7 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  27.21 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  28.76 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  28.05 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  28.53 
 
 
409 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  28.9 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>