60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4195 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  761    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  62.43 
 
 		 381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  40.06 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  38.44 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  39.61 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  38.4 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  38.55 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  41.94 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  41.34 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  37.54 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  37.33 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  37.46 
 
 		 367 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  36.59 
 
 		 365 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  38.18 
 
 		 374 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  33.97 
 
 		 369 aa  232  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  35.71 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  33.33 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  36.2 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  37.22 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  36.97 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  36.69 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  32.56 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  36.18 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  35.1 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  37.97 
 
 		 362 aa  199  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  33.54 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  34.64 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  34.5 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  29.97 
 
 		 371 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  28.03 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  34.36 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  29.1 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  34.55 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  28.38 
 
 		 370 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  26.69 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  27.86 
 
 		 357 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  29.81 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  26.06 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  29.02 
 
 		 999 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  29.71 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  26.59 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 		 994 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  28.42 
 
 		 983 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  27.64 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  26.86 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  23.66 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  25.54 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  23.81 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  22.22 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  24.78 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  23.64 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  24.78 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  26.29 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  25.34 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  24.84 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  25 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  23.23 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  23.73 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  22.7 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  21.9 
 
 		 427 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>