59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3365 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  58.72 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  47.04 
 
 
366 aa  351  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  54.8 
 
 
362 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  50.15 
 
 
367 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  52.26 
 
 
366 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  51.41 
 
 
365 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  55.56 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  53.45 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  44.44 
 
 
367 aa  340  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  48.73 
 
 
369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  51.21 
 
 
361 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  42.94 
 
 
369 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  44.04 
 
 
369 aa  316  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  50.62 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  46.89 
 
 
356 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  45.53 
 
 
367 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  47.49 
 
 
367 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  48.31 
 
 
368 aa  266  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  42.74 
 
 
372 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  45.07 
 
 
362 aa  261  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  44.51 
 
 
367 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  42.94 
 
 
374 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  41.67 
 
 
360 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  44.13 
 
 
375 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  40.28 
 
 
381 aa  235  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  36.18 
 
 
374 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  38 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  35.92 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  34.07 
 
 
369 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  37.57 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  39.5 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  37.04 
 
 
370 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  36.29 
 
 
354 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  30.94 
 
 
348 aa  171  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  33.89 
 
 
357 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  33.24 
 
 
983 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  31.02 
 
 
373 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  28.57 
 
 
371 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  32.22 
 
 
369 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  30 
 
 
372 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 
994 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  31.75 
 
 
999 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  33.88 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  31.4 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  31.71 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  29.1 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  28.57 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  31.2 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  25.81 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  28.66 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  28.66 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  27.71 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  23.6 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  25 
 
 
365 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  25.45 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  24.84 
 
 
365 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  25.93 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  27.27 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>