54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1543 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  752    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  44.24 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  34.27 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  33.06 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  32.58 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  33.92 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  34.4 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  32.71 
 
 		 367 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  34.44 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  34.21 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  29.83 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  31.25 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  31.86 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  34.45 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  31.65 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  30.29 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  30.08 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  31.97 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  29.86 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  32.09 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  29.75 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  29.12 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  31.02 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  26.63 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  27 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  28.93 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  27.08 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  28.21 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  27.49 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  29.17 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  27.4 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  29.81 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  27.2 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  26.29 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  28.07 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  27.22 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  26.19 
 
 		 999 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  24.42 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  27.14 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  22.74 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  25.08 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  24.15 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  25.6 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 		 994 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  25.33 
 
 		 983 aa  87  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  23.96 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  23.21 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  23.3 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  23.78 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  26.17 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  25.74 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  20.81 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  22.64 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>